علم الجينوم البنيوي

(تم التحويل من Structural genomics)

علم الجينوم البنيوي Structural genomics، هو علم يبحث في وصف البنية ثلاثية الأبعاد لأي بروتين عن طريق الجينوم.

الأهداف

الأساليب

de novo methods

Modelling-based methods

ab initio modeling

Sequence-based modeling

Threading

أمثلة على علم الجينوم البنيوي

The Thermotogo maritima proteome

The Mycobacterium tuberculosis proteome

قواعد بيانات وتصنيفات بنية البروتين

انظر أيضا

المصادر

  • Hooft RW, Vriend G, Sander C, Abola EE (1996). "Errors in protein structures". Nature. 381 (6580): 272. doi:10.1038/381272a0. PMID 8692262. {{cite journal}}: Unknown parameter |month= ignored (help)CS1 maint: multiple names: authors list (link)
  • Marsden RL, Lewis TA, Orengo CA (2007). "Towards a comprehensive structural coverage of completed genomes: a structural genomics viewpoint". BMC Bioinformatics. 8: 86. doi:10.1186/1471-2105-8-86. PMC 1829165. PMID 17349043.{{cite journal}}: CS1 maint: multiple names: authors list (link) CS1 maint: unflagged free DOI (link)
  • Baker EN, Arcus AL, Lott JS. 2003. Protein structure prediction and analysis as a tool for functional genomics. ‘’Applied Bioinformatics’’ 2(3 Suppl):S3-S10.
  • Goulding CW ‘’et al’’. 2003. Structural genoimcs of ‘’Mycobacterium tuberculosis’’: a preliminary report of progress at UCLA. ‘’Biophysical Chemistry’’ 105: 361-370.
  • Lesley SA ‘’et al’’. 2002. Structural genomics of the ‘’Thermotoga maritima’’ proteome implemented in a high-throughput structure determination pipeline. ‘’PNAS’’ 99(18):11664-11669.
  • Skolnick J, Fetrow JS, and Kolinski A. 2000. Structural genomics and its importance for gene function analysis. ‘’Nature Biotechnology’’ 18:283-287.

وصلات خارجية